A-lokus eli agouti-sarja

A
tämä alleeli on ns. dominoiva musta ja se tuottaa kokomustan koiran. Valkoisia merkkejä aiheuttaa aivan oma geeninsä, niihin tulemme myöhemmin. Täysin yksiväriselläkin koiralla voi silti olla pieniä valkoisia merkkejä esimerkiksi rinnassa tai varpaankärjissä, ilman että sillä olisi varsinaista valkoisia merkkejä aiheuttavaa geeniä. Tätä alleelia esiintyy roduistamme vain suurella japanilaisella, vaikka shiballa kokomusta oli hyväksytty väri vielä muutama vuosikymmen sitten
ay
tämä alleeli on dominoiva punainen ja se tuottaa punaisen värin aina vaalean keltaisesta hehkuvan pronssin väriin. Tyypillisesti ay ay koiralla on tummempi selkäpuoli ja vaaleampi alapuoli, ts. kuono, posket, kaula, rinta, vatsa, hännän alapuoli sekä jalkojen alaosat. Toisin sanoen akitoilla ja shiboilla pakollinen urajiro. Tämä alleeli esiintyy myös great japanese dog'lla vaikka se ei olekaan ainoa, joka aikaansaa punaisen värin suurella japanilaisella.
am
tämä alleeli aiheuttaa manttelikuvion, kuten saksanpaimenkoirilla. Tämä alleeli esiintyy great japanese dog -rodussa.
at
tämä alleeli aiheuttaa mustan koiran ruskeilla merkeillä, eli shibojen black&tanin. Vaikka se yleensä on resessiivinen ay-alleeliin nähden, voi se joskus periytyä myös välimuotoisesti, jolloin yhdistelmän ay at tuloksena on punaseesami. Myös geneettisesti puhdas ay ay punainen voi kantaa mustia karvoja turkissaan. Näemme joskus akitoja, joilla on yksittäisiä seesamikarvoja esim lapojen välissä. On silti epätodennäköistä, että ne olisivan at-alleelin aiheuttamia, sillä black&tan-väriä ei tiettävästi esiinny akitoilla lainkaan. En ole myöskään kuullut koskaan b&t great japanese dog'sta.
aw
"villi" väri eli suden väri, esimerkiksi harmaanorjanhirvikoirilla tai pippuri ja suola snautsereilla. Harmaan gjd:n aiheuttaa luultavasti jokin muu geeni, koska tämä aiheuttaa yksittäiseen karvaan selvää värien vyöhykkeisyyttä, jota en ole havainnut harmailla gjd:illa

B-lokus eli ruskea-sarja

B
tämä alleeli aiheuttaa täyden värin syvyyden. Kaikilla kolmella rodullamme on tiettävästi tämä ja vain tämä alleeli B-sarjasta
b
tämä alleeli aiheuttaa mustan pigmentin vaalenemisen ruskeaksi tai punaiseksi. Esimerkiksi ruskea labradorinnoutaja (A-bb), ruskea dobermanni (at at b b) tai faaraokoira (A ? b b). b-alleelin aiheuttaman punaisen erottaa esim ay punaisesta siitä, että b vaalentaa myös kirsun maksanväriseksi ja silmät vaaleanruskeiksi/keltaisiksi.

C-lokus eli albino-sarja

C
tämä alleeli aiheuttaa täyden värin syvyyden.
cch
tätä alleelia kutsutaan chinchillaksi. Se poistaa karvoista keltaisen värin mutta ei vaikuta mustaan. Tämä geeni saattaa olla vastuussa shibojen "valkoseesami" väristä, josta en ikinä ole nähnyt edes kuvaa. Teoriassa ayatcch cch koira vastaisi kuitenkin hyvin rotumääritelmän kuvausta valkoisesta seesamista.
ce
eli äärimmäinen diluutio. Tämä geeni on mahdollisesti vastuussa roduissamme esiintyvistä valkoisita/kermanvärisistä koirista (tosin GJD:lla esiintyy myös geneettisesti erilainen valkoinen, tulemme siihen myöhemmin) ce-alleeli vaalentaa homotsygoottina turkin aina äärimmäiseen valkoiseen asti, muttei vaikuta silmien väriin.
cd
joissain lähteissä mainitaan cd -"samojedinvalkoinen", valkoinen koira, jolla on musta kirsu ja silmäluomet. En tiedä onko tämä sama alleeli kuin edellinen, ja vaikuttaisiko kirsun väriin jokin toinen muuntelija. Kaikissa kolmessa rodussamme on kuitenkin valkeita yksilöitä, joilla on tumma kirsu, mutta lihanvärinen kirsu on myös yleinen.

C-lokuksessa esiintyy muutamia muitakin alleeleja, mutta niitä ei tavata roduissamme. C-sarjan alin alleeli on c - se aiheuttaa täydellisen albinismin.

D-lokus eli sininen-sarja

D
aiheuttaa täyden värin syvyyden. Kaikissa kolmessa rodussamme esiintyy tämä ja vain tämä alleeli.
d
aiheuttaa mustan värin haalistumisen siniseksi, esim. sininen tanskandoggi. Tämäkään tuskin on vastuussa harmaista gjd:sta sillä d haalistaa myös kirsun ja silmien väriä kuten b.

E-lokus eli laajennus-sarja

Tämän sarjan alleeleista ei olla päästy yksimielisyyteen. Kuuluvatko ne kaikki todella E-sarjaan, vai sijaitsevatko ne omissa lokuksissaan? On esitetty painavia todisteita siitä, että ainakin brindlen ja maskin aiheuttavat geenit sijaitsevat eri lokuksissa ja periytyvät näin ollen erillään, mutta kuuluuko niistä jompikumpi tai kumpikaan E-sarjaan ei ole saatu täyttä selvyyttä. On kuitenkin todennäköistä että maski-geeni periytyy erillisenä, ja brindle kuuluu E-sarjaan, mutta jos joku muuta uskoo, en ala väittämään vastaan. Luettelen alleelit tässä nyt niin kuin minä uskon niiden olevan.

Ebr
brindle-alleeli aiheuttaa mustaa pigmenttiä tuottavien solujen kerääntymisen raidoiksi ja aiheuttaa näin ollen tummia juovia punaisella pohjalla. Brindlen värin syvyys voi vaihdella lähes mustasta punaisen ja mustankirjavan kautta vaalean harmaaraidalliseen - todennäköisesti värin syvyyteen vaikuttaa joukko erilaisia muuntelijoita. Brindle ei näy mustalla pohjalla, toisin sanoen A- eli musta koira voi olla genotyypiltään brindle, vaikka raidat eivät näykään. at at Ebr - koiralla on normaali musta väritys, mutta tan-pointit ovat brindle-geenin vaikutuksesta raidoittuneet.
E
normaali värin syvyys, eli ei-brindle koira. Punaiset akita ja shiba sekä black&tan shiba omaavat tämän geenin homotsygoottina.
e
resessiivinen keltainen (punainen). Tämä alleeli esiintyy todennäköisesti suurella japanilaisella aiheuttaen yksivärisen punaisen koiran, jolla ei ole urajiroa. Tätä alleelia ei todennäköisesti esiinny akitalla ja shiballa.

Ma - lokus eli maskisarja

Uskon että maskin aiheuttava geeni sijaitsee omassa lokuksessaan, mutta tämä on vain minun mielipiteeni.

Ma
aiheuttaa mustan maskin. Tähänkin geeniin vaikuttaa ilmeisesti erilaisia muuntelijoita, sillä maski voi olla vain musta kuono tai koiran koko pää voi olla musta. Myös koiran jalat voivat olla mustat tämän geenin vaikutuksesta. Esiintyy suurella japanilaisella.
ma
ei maskia. Tämä ja vain tämä geeni esiintyy akitalla ja shiballa.

G-lokus eli harmaa-sarja

Tämä sarja on huonosti tunnettu.

G
alleeli aiheuttaa värillisten karvojen korvaantumisen valkoisilla eläimen vanhetessa ja uskotaankin tämän geenin olevan kyseessä, kun tummana syntynyt pentu vaalenee aikuisuutta kohti jokaisen karvanvaihdon myötä. Great Japanese Dog'lla tunnetaan tällainen värin asteittainen vaaleneminen, joten niillä saattaa olla G - alleeli. Ehkäpä harmaa gjd on tämän geenin työn tulosta - nehän syntyvät usein tummina.
g
väri ei vaalene iän myötä.

M-lokus eli merle-sarja

Tämän sarjan M-geeni saattaa homotsygoottina aiheuttaa kuuroutta, sokeutta, silmien kääpiökasvua ja lisääntymisongelmia. Siksi kahta merle-koiraa ei pidä parittaa keskenään.

M
alleeli aiheuttaa värin haalistumisen läiskittäin aiheuttaen esim. mustaan väriin siniharmaita läiskiä. Tätä alleelia ei esiinny japanilaisissa roduissamme.
m
alleeli aikaansaa normaalin värin syvyyden.

R-lokus eli roan-sarja

Saattaa olla, että tätä sarjaa ei ole koirilla olemassakaan, vaan roan-väri voi yksinkertaisesti olla erittäin tasaista ja voimakasta pilkutusta valkoisella pohjalla. Toinen roanin muoto, jossa värillisellä alueella kasvaa tasaisesti valkoisia karvoja, voi olla G-geenin aiheuttama. Oli miten oli, Roan (R) näyttäisi oleva dominoiva ei-roaniin (rr) nähden, eikä roania (R) tiedetä esiintyvän japanilaisissa roduissamme.

S-lokus eli valkoiset merkit -sarja

Tämän sarjan alleeleihin vaikuttaa epälukuinen joukko voimistavia tai lieventäviä muuntelijoita ja sen lisäksi sattumalla on erittäin suuri osuus värillisten alueiden lopulliseen jakautumiseen kehittyvässä koirayksilössä. Silti muutamia selkeästi erotettavia alleeleita voidaan tunnistaa. Kaikki alleelit saattavat periytyä osittain välimuotoisesti.

S
yksivärinen. S S -koira on yleensä täysin yksivärinen, mutta sillä voi myös olla vähäisiä valkoisia merkkejä varpaan kärjissä, rinnassa ja hännänpäässä.
si
irish spotting. Tämä on geeni joka tyypillisesti vastaa akitalla ja shiballa esiintyvistä valkoisista kuvioista. si si koirilla on tyypillisesti valkoinen kuono, kaula, rinta, sukat sekä hännänpää. Myös niskassa voi olla valkoinen täplä, tai peräti valkoinen kauluri kuten colliella (ei toivottavaa). Luonnollisesti GJD:lla esiintyy sama kuviointi.
sp
piepald eli valkotäpläinen. Tyypillistä tälle kuvioinnille on että yli 50% koirasta on valkoinen. Valkoiset alueet ylittävät usein selän keskilinjan ja yleensä ottaen piepald-koira antaa vaikutelman valkoisesta koirasta, jolla on värillisiä läikkiä. Esiintynee suurella japanilaisella (pinto).
sw
äärimmäinen valkoinen. Väritys vaihtelee värillisestä päästä värilliseen päähän ja muutamaan värilliseen läikkään rungossa (tyypillisesti hännän tyvessä). Homotsygoottina tämä geeni saattaa aikaansaada täysin valkoisen koiran. Tämä väritys on tunnettu suurella japanilaisella (pinto ja valkoinen).

T-lokus eli pilkutus-sarja

Tähänkin geeniin vaikuttaa voimistavia ja laimentavia muuntelijoita. T-sarjan geeni on mm. dalmatialaisen pilkut aiheuttava geeni, johon me emme kuitenkaan tässä puutu. Meidän roduissamme esiintyvät pilkut ovat pieniä ja vaatimattomia.

T
alleeli aiheuttaa pilkutusta S-sarjan geenin määräämille valkeille alueille. Tämä alleeli todennäköisesti esiintyy kaikissa roduissamme. Punaisella koiralla vain pilkut eivät ole yhtä helposti havaittavat kuin tummalla, eikä brindlenkään jaloista ole pilkkuja raidoilta helppo erottaa. Olen silti nähnyt pilkkuja b&t shiban jaloissa (tan-värisiä tietenkin!) ja great japanese dog'lla T-alleelin läsnäolosta ei ole epäilystä.
t
ei pilkutusta.

No niin! Siinähän ne! Niin kuin huomaat, aika tavalla erilaisia geenejä, eikä tässä ole vielä edes läheskään kaikkia. Mutta mitä tämä kaikki tarkoittaa käytännössä? Tutustu esimerkkeihini!